Pembangunan di bidang agama terutama di bidang pendidikan memiliki kedudukan dan peranan yang sangat penting dalam meletakkan landasan moral, etika, teknologi dan spiritual yang kokoh dalam pembangunan di bidang Pendidikan Nasional.
Proses pengembangan di bidang pendidikan diarahkan pada upaya meningkatkan kecerdasan bangsa, meningkatkan kuwalitas dan kuantitas anak didik (siswa), maka pendidikan agama merupakan sarana untuk menambah semarak dan menambah kenikmatan beragama serta meningkatkan ketakwaan terhadap Allah SWT. Karena berperan dalam memlihara kesatuan dan persatuan bangsa, apa lagi pada saat-saat sekarang ini.
Pendidikan agama sangat memegang peranan untuk menciptakan anak didik yang bermoral dan berakhlak mulia. Sejalan hal tersebut, maka Madrasah Tsanawiyah Negeri Lhokseumawe merupakan salah satu lembaga pendidikan yang berada di bawah naungan Departemen Agama RI merupakan salah satu lembaga pendidikan tertinggi menengah pertama yang berstatus negeri.
MTsN Lhokseumawe merupakan salah satu madrasah di bawah instansi Kementerian Agama Kota Lhokseumawe, yang letaknya sangat strategis dan mudah dijangkau oleh seluruh lapisan masyarakat.
Dengan lahirnya undang-undang pendidikan nomor 2 tahun 1989 diberlakukan kurikulum 1994 sejak tahun ajaran 1994/1995, kurikulum MTsN khususnya pengetahuan umum persis sama dengan kurikulum yang ada SMP ditambah lagi dengan pelajaran agama sebagai ciri khas Madrasah agama.
Karena perkembangan zaman dituntut siswa memiliki pengetahuan kecakapan dan keterampilan yang lebih khusus di bidang agama pada tahun ajaran 2008/2009 maka dibuka kelas Rintisan Madrasah Berstandar Internasional (RMBI) untuk membekali siswa dengan berbagai pengetahuan yang lebih dari siswa kelas regular.
Madrasah Tsanawiyah Negeri Lhokseumawe juga berusaha meningkatkan kemampuan dan kreatifitas siswa dibidang seni maupun olahraga, lulusan MTsN Lhokseumawe dengan demikian mareka memiliki peluang yang sama dengan lulusan SMP untuk mengisi peluang yang ada untuk memasuki Sekolah ke jenjang selanjutnya. MTsN Lhokseumawe adalah satu-satunya Madrasah Negeri yang letaknya di tengah-tengah Kota Lhokseumawe.
Tahun Berdiri
Madrasah Tsanawiyah Negeri (MTsN) Lhokseumawe, merupakan Madrasah menengah pertama yang berciri khas agama yang setingkat dengan SMP yang berada di kota Lhokseumawe, Madrasah Tsanawiyah Negeri Lhokseumawe didirikan pada tahun 1982, yang merupakan peralihan dari PGAN 6 tahun berdasarkan SK Menteri Agama RI nomor : 642-2/1412 tanggal 7 Juli 1982.